تعمل كلية العلوم – جامعة الازهر- فرع اسيوط على تقدم العلوم الاساسية والتطبيقية وخدمة المجتمع وتزويد المجتمع المحلى والاقليمى والدولى بكوادر علمية متخصصة يجمعون الى الايمان بالله والثقة بالنفس، كفاية علمية و عملية و مهنية لتأكيد الصلة بين الدين الاسلامى والحياة وفق سياسات تتسم بالشفافية وتكافؤ الفرص وزيادة مستويات المشاركة فى صنع القرار وإتخاذه لتحقيق الرسالة العامة للازهر الشريف والاهداف القومية والانسانية.