يعتبر الاكواريوم من النقاط القويه فى مجال علوم البحار بالكليه وامكانيته التنافسيه بين الكليات والجامعات المختلفه حيث يتميز بمساحته الكبيره التى تحوى الكثير من الاحواض الزجاجيه التى تكفى للكثير من الباحثين العمل فى نفس التوقيت كما تتميز هذه الاحواض باختلاف سعتها لتناسب التجارب المختلفه . وهذا المعمل شهد الكثير من ابحاث ورسائل الماجستير والدكتوراه للباحثين من القسم وخارج القسم والكليه ايضا فى مجالات الاستزراع السمكى والتلوث المائى ويتم فيه ايضا تدريب الطلاب عمليا على كيفية اجراء التجارب ومتابعتها والحفاظ على جودة المياه وصحة الكائنات الحيه كما تم تهيئة طاوله كبيره من الرخام لشرح العملى لعدد كبير وبالتالى تعظيم الفائده التعليميه بدون الازدحام وانخفاض الاستيعاب لدى الطلاب والمتدربين .