تعمل كلية العلوم- جامعة الأزهر- فرع أسيوط على تقدم العلوم الأساسية والتطبيقية وخدمة المجتمع وتزويد المجتمع القومى والإقليمى بكوادر علمية متخصصة يجمعون إلى الإيمان بالله والثقة بالنفس ، كفاية علمية وعملية ومهنية لتأكيد الصلة بين الدين الإسلامى والحياة وفق سياسات تتسم بالشفافية وتكافؤ الفرص، لتحقيق رسالة الجامعة والرسالة  العامة للأزهر الشريف والأهداف القومية والإنسانية