1)  قسم الشئون الإدارية ويتفرع من القسم مكتب شئون العاملين – أرشيف – الشئون العام
2)  قسم شئون التعليم والطلاب  ويتفرع من القسم :مكتب شئون الطلاب –مكتب الخريجين –المكتبة  والمكتبة السمعية لذوي الاحتياجات الخاصة
3)  قسم شئون المالية
4)  قسم الدراسات العليا
5)  قسم رعاية الشباب
6)  الوحدة الطبية
7)  مكتب الشئون الهندسية
8)  قسم شئون الدراسة

بالاضافة الى إنشاء قسم تحقيق التراث ويهدف إلى تحقيق المخطوطات التفسيرية والحديثية ..... إلخ من المخطوطات التي تربط الماضي بالحاضر وفق رسالة الجامعة.
وتضافر كل هذه الأقسام بالإضافة إلى جمعية التوعية الدينية، ومركز الموهبة والإبداع بالكلية في إبراز الشعار الذي اتخذته الكلية وهو رفع اسم جامعة الأزهر ورايته عالية خفاقة ، وإظهار قوة الأزهر وأبنائه وإثبات الجداوة المستحقة للأزهر (جامعاً وجامعة).