تسعى كلية البنات الازهرية بطيبة الاقصر إلى تحقيق رؤيتها ورسالتها من خلال منظومة من الأهداف تتمثل في ما ياتي: 
 ١- تعزيز الانتماء الى مؤسسة الازهر الشريف لما يتمتع به من رؤية وسطية تستند الى ثوابت الشريعة واصول الدين ومسايرة لكل ما هو جديد من الوسائل الحديثة في مجالات العلم المختلفه بما لا يخرج عن نطاق الشرع والدين.
 ٢- تنميه مهارات وقدرات اعضاء هيئه التدريس والهيئة المعاونة لتواكب المستويات القياسية للمعرفة العالمية.
٣- تعزيز الانفتاح على العالم الخارجي على المستوى الاكاديمي والبحثي والبحث العلمي.
٤-  اعداد طالبات متميزات من اقسام الشريعة الإسلامية واصول الدين واللغة العربية واللغات الأوروبية والترجمة الفورية يكن قادرات على المنافسة في مجال التدريس. 
٥- نشر العلم الشرعي والوعي الديني الصحيح بين افراد المجتمع ومؤسساته من خلال المشاركة في برامج التوعيه المختلفة.
٦- تنمية الموارد المالية والبشرية للكليه.
٧- زيادة المشاركة الفعالة للكلية في خدمة المجتمع والبيئة. 
٨- التحسين والتطوير المستمر للعملية التعليمية بالكلية وفق معايير الجودة الشاملة.
٩- دعم منظومة البحث العلمي لمواكبة التطورات العلمية والتقنية العالمية.
١٠- رفع كفاءة الجهاز الاداري لتحقيق الفاعلية والانسيابية للعمل الاداري. 
١١- ترسيخ القيم الحضارية والإنسانية انطلاقا من رسالة السلام العالمية التي تساهم في نشر ثقافة السلام والتعايش السلمي بين الامم والشعوب.