يهدف المركز الى تحقيق الاهداف العامة و الخاصة و ذلك عن طريق زيادة الكفاءة للاجهزة العاملة فى حالات الاعاقة و مشكلاتها و القيام ببرامج استعراضية ووقائية و علاجية للمعوقين و اسرهم و تتلخص اهداف المركز فيما يلى :

 التعرف على حجم مشكلة اعاقات الطفولة فى المجتمع

 تصنيف مسببات الاعاقة ( طبيا – اجتماعيا – سلوكيا )

 التعرف على وسائل الاكتشاف المبكر للاعاقة

 اعداد برامج وقائية و علاجية للاطفال المعوقين و اسرهم

تجسيد التكامل بين جامعة الازهر ووزارات التعليم و الشئون الاجتماعية و الصحية

 اصدار مجلة علمية محكمة تحمل اسم المركز لنشر البحوث و الدراسات فى مجال الاعاقة

 عقد الدورات التدريبية و الاجتماعات و محاضر و مؤتمرات عامة فى شئون الاعاقة